Introducción: Recientemente, se ha observado en Cuba, una tendencia al incremento de pacientes que desarrollan sida pocos años después del diagnóstico de VIH.

Objetivo: Identificar marcadores virales y de respuesta inmune que pudieran asociarse a la rápida progresión a SIDA.

Metodología: Se estudiaron 95 individuos cubanos seropositivos a  VIH-1; 52 progresaron a SIDA en menos de 3 años (PR), 22 eran pacientes en estado sida que progresaron en 8 a 10 años (PNS) y 21 eran seropositivos con 2-5 años de diagnóstico sin progresar a sida (PN). Se colectó la información clínica, demográfica, virológica, epidemiológica e inmunológica. Las secuencias de los genes pol y env de VIH-1 fueron utilizadas para determinar el subtipo viral, el uso del co-receptor, análisis de clusters de transmisión, resistencia antirretroviral y fijación evolutiva (genotypic fitness landscape).

Resultados: Los principales subtipos fueron: B (26,3%), C (6,3%), CRF18_cpx (7,4%), CRF19_cpx (9,5%), CRF_BG 20-23-24 (32,6%). El Subtipo B fue mas prevalente entre PN vs PR (p=0.034). Todos los CRF19_cpx se observaron en los PR (p=0.0090), mostraron mayor fitness en la región de proteasa y mayores niveles de carga viral. Ninguno de los virus de los pacientes se agrupó en un cluster de transmisión. La resistencia transmitida fue del 10% entre los grupos recientemente infectados. El uso del co-receptor X4 o r5x4 fue más común en los PR (57.89%).

Conclusión: Por primera vez se describe la asociación de una variante viral de VIH-1 de origen cubano, con rápida progresión a sida.